講演抄録/キーワード |
講演名 |
2012-06-28 17:10
[招待講演]PhysioDesignerを用いた神経系を含む生体生理機能の多階層モデリングならびにシミュレーション ○浅井義之(沖縄科技大)・北野宏明(沖縄科技大/システム・バイオロジー研究機構) NC2012-12 |
抄録 |
(和) |
システムバイオロジー,統合的生命科学という新しい研究分野の発展にともない,多階層的な生理機能の数理モデルならびにそのシミュレーションが果たす役割の重要性が増してきている.本稿では,そのようなモデル開発ならびにシミュレーションをサポートするために提案されたモデル記述言語PHML,ならびにアプリケーションであるPhysioDesignerついて概説する.PhysioDesignerは,ユーザーがグラフィカルなインターフェイスを用いて階層的生理機能の数理モデルを構築できるモデリングプラットフォームである.モデルはPHML形式で保存される.これらのモデルのシミュレーションはFlintと呼ばれるアプリケーションを用いて実行できる.また,PHMLと互換性のあるISML形式のモデルデータベースがphysiome.jpで公開されている.これらのツール群により統合的生命科学におけるモデリングならびにシミュレーションをサポートする. |
(英) |
As new interdisciplinary scientific research fields such as integrated life science is advancing, the importance of mathematical modelings and simulations of multilevel physiological systems are increasing. This article introduces a software application PhysioDesigner and model description language PHML which have been developed for supporting such modeling and simulations. PhysioDesigner provides graphical user interface to build models of physiological functions. Those models created on PhysioDesigner were written in PHML format, which is a specification of XML. Simulations on the models can be done with Flint application which has been developed concurrently with PhysioDesigner. Flint can perform a parallel computing for big simulations. In Physiome.jp, there is a model database of ISML which is XML based modeling language perfectly compatible with PHML. |
キーワード |
(和) |
多階層モデリング / システムバイオロジー / 並列計算 / 統合的生体機能学 / / / / |
(英) |
Multilevel modeling / Systems biology / Parallel computing / Integrated physiology / / / / |
文献情報 |
信学技報, vol. 112, no. 108, NC2012-12, pp. 93-95, 2012年6月. |
資料番号 |
NC2012-12 |
発行日 |
2012-06-21 (NC) |
ISSN |
Print edition: ISSN 0913-5685 Online edition: ISSN 2432-6380 |
著作権に ついて |
技術研究報告に掲載された論文の著作権は電子情報通信学会に帰属します.(許諾番号:10GA0019/12GB0052/13GB0056/17GB0034/18GB0034) |
PDFダウンロード |
NC2012-12 |
研究会情報 |
研究会 |
NC IPSJ-BIO |
開催期間 |
2012-06-28 - 2012-06-29 |
開催地(和) |
沖縄科学技術大学院大学 |
開催地(英) |
OIST, Okinawa |
テーマ(和) |
機械学習によるバイオデータマインニング、一般 |
テーマ(英) |
Machine Learning Approach to Biodata Mining, and General |
講演論文情報の詳細 |
申込み研究会 |
NC |
会議コード |
2012-06-NC-BIO |
本文の言語 |
日本語 |
タイトル(和) |
PhysioDesignerを用いた神経系を含む生体生理機能の多階層モデリングならびにシミュレーション |
サブタイトル(和) |
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タイトル(英) |
Multilevel modeling of physiological systems and nervous systems using PhysioDesigner |
サブタイトル(英) |
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キーワード(1)(和/英) |
多階層モデリング / Multilevel modeling |
キーワード(2)(和/英) |
システムバイオロジー / Systems biology |
キーワード(3)(和/英) |
並列計算 / Parallel computing |
キーワード(4)(和/英) |
統合的生体機能学 / Integrated physiology |
キーワード(5)(和/英) |
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キーワード(6)(和/英) |
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キーワード(7)(和/英) |
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キーワード(8)(和/英) |
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第1著者 氏名(和/英/ヨミ) |
浅井 義之 / Yoshiyuki Asai / アサイ ヨシユキ |
第1著者 所属(和/英) |
沖縄科学技術大学院大学 (略称: 沖縄科技大)
Okinawa Institute of Science and Technology (略称: OIST) |
第2著者 氏名(和/英/ヨミ) |
北野 宏明 / Hiroaki Kitano / |
第2著者 所属(和/英) |
沖縄科学技術大学院大学/システム・バイオロジー研究機構 (略称: 沖縄科技大/システム・バイオロジー研究機構)
OIST/Systems Biology Institute (略称: OIST/Systems Biology Institute) |
第3著者 氏名(和/英/ヨミ) |
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第4著者 氏名(和/英/ヨミ) |
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講演者 |
第1著者 |
発表日時 |
2012-06-28 17:10:00 |
発表時間 |
60分 |
申込先研究会 |
NC |
資料番号 |
NC2012-12 |
巻番号(vol) |
vol.112 |
号番号(no) |
no.108 |
ページ範囲 |
pp.93-95 |
ページ数 |
3 |
発行日 |
2012-06-21 (NC) |